R语言数据可视化之美专业图表绘制指南（增强版）：第1章 R语言编程与绘图基础

第1章 R语言编程与绘图基础

前言

这是我第一次在博客里展示学习中国作者的教材的笔记。我选择这本书的依据是作者同时具有严谨性和易读性，所以该书适合学习者从了解计算机语言逐渐过渡到运用，为创建论文图表、学习数据分析奠定基础。

本书主要介绍如何使用R中的ggplot2包及其拓展包，以及ggraph、circlize和plot3D等包绘制专业图表。本书先介绍了R语言编程基础知识，以及使用dplyr、tidyr、reshape2等包的数据操作方法；再对比了base、lattice和ggplot2等包的图形语法。本书系统性地介绍了使用ggplot2包及其拓展包绘制类别对比型、数据关系型、时间序列型、整体局部型、地理空间型等常见的二维图表的方法，ggraph、 igraph、circlize等包绘制层次、网络关系型图表，以及使用plot3D包绘制三维图表（包括三维散点图、柱形图和曲面图等）的方法。另外，本书也介绍了论文中学术图表的图表配色、规范格式等相关技能与知识。

请跟我一起学习吧！

1.1 学术图表的基本概念

．数据展示图：先根据数据绘制成图表，再将其导出生成图片，主要包括各种点线图、柱形图、饼图等统计图表，一般使用Excel、GraphPadPrism、SigmaPlot、Origin、MATLAB、Python、R等专业绘图软件绘制（Excel并非如大众所说不能导出高分辨率的图片和矢量图）。注意，保存图片时，一定要保存成高分辨率的TIFF格式和EPS矢量格式的图片，因为矢量图片是可以使用图片处理软件进行再编辑的。由数据生成的图表是可重复修改的，因此一定要保存好原始数据，一旦发现图表有任何问题可以马上进行修改。

2．实验拍摄图：使用设备或者仪器拍摄采集的图片，包括显微镜、扫描仪及摄像机等所拍照片。一定要在最刚开始时就拍成高清的（设置成高分辨率），也就是要保证原始图片的高分辨率，接下来处理图片就会比较方便，免得因为图片质量不佳而重复实验。若有必要，则可以将每张图片存储成TIFF和JPG两种格式（以应对部分期刊的特殊要求）。

3．流程示意图：使用简明的线条、基本图形和箭头等绘制论文中的重要的实验