将Dicom数据集转换成raw+mhd文件

最新推荐文章于 2026-05-02 09:31:25 发布
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#dicom #raw #mhd #medical image processing
本文介绍了如何将Dicom数据集转换为raw+mhd格式，用于医疗图像处理。首先提到了原始方法，即使用info.txt文件，然后详细讨论了两种解决方案：通过itk-snap手动转换和使用C3D工具进行批量处理。C3D是一款医学图像处理软件，支持命令行操作，可以方便地处理大量数据。
问题

原本项目用的都是自己用程序合并的raw和info.txt，info.txt里只包含Dimension和Spacing。
info.txt格式如下：

512 512 49
0.693359 0.693359 3

VNet框架需要使用到raw和mhd文件，mhd文件格式如下：

ObjectType = Image
NDims = 3
BinaryData = True
BinaryDataByteOrderMSB = False
CompressedData = False
TransformMatrix =
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c3d-nightly-win64-AMD64.exe
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C3D是用于在常见文件格式之间转换3D图像的命令行工具。该工具还包括越来越多的用于图像处理的命令列表，例如阈值和重采样。 C3D是医学成像“瑞士军刀”- Convert3D允许用户将一种文件类型转换为另一种文件类型。当前，Convert3D允许将.c3d文件转换为.cmo文件，并将.txt文件转换为Visual3D可以读取的.txt文件。每种文件转换类型在程序中都有单独的选项卡。
python DICOM文件转mha/mhd
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pip3 install SimpleITK pip3 install opencv-python
VTK读取三维Mhd文件，并把数据存放在三维数组里
Dezeming的博客
05-23 6550
mhd文件包含一个.mhd用来存放信息，和一个.raw文件来存放数据。 我们用记事本随便打开一个三维的Mhd文件： ObjectType = Image NDims = 3 BinaryData = True BinaryDataByteOrderMSB = False CompressedData = True CompressedDataSize = 6193601 TransformMatrix = 1 0 0 0 1 0 0 0 1 Offset = -125 -858 -63 CenterO
别再为DICOM数据发愁了！手把手教你用Python和pydicom批量生成‘算法友好’的伪DICOM文件
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dicom文件转为mhd，raw文件
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10-13 402
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用python批量把DICOM(dcm)转换成jpg图像
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Deeplung:深度学习项目笔记（二）——医学影像学dicom,mhd及raw文件读取与可视化
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