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本博客探讨了R语言在处理医学大数据，特别是coronavirus数据时的应用。首先，通过R语言查询并理解coronavirus数据集的结构，然后筛选出中国、法国和澳大利亚的数据，展示了这三个国家的confirmed、death和recovery总数。接着，分析了这些国家的新增病例趋势，并制作了时间动态变化图。此外，对比了非洲和亚洲国家COV19的严重情况。在转录组学分析部分，读取并处理表达数据，进行了DESeq分析，包括PCA图、差异表达基因筛选和富集分析。
library(tidyverse)
library(airway)
library(DESeq2)
library(pheatmap)
library(RColorBrewer)
library(ggbeeswarm)
library(genefilter)
library(coronavirus)
library(lubridate)
library(gganimate)
R 语言基础部分
- 用 help 或者？查询 coronavirus 数据，提取出该数据的所有列信息（比
如 date 指代什么），以文本注释的形式写在报告中，此时代码块输出设置为
“show nothing”。
help(coronavirus)
Format
A data frame with 7 variables.
date: Date in YYYY-MM-DD format.
province: Name of province/state, for countries where data is provided split across multiple provinces/states.
country: Name of country/region.
lat:Latitude of center of geographic region, defined as either country
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