基于共刺激分子的纯生信分析发2区5分+期刊，这个思路值得一看

小编今天解读的这篇文章是2020年发表在杂志OncoImmunology（IF: 5.869）上,题目为Identification of a costimulatory moleculebased signature for predicting prognosis risk and immunotherapy response in patients with lung adenocarcinoma。作者对LUAD患者进行了共刺激分子景观分析。建立了一个可靠的，临床上可行的预后特征模型，命名为CMS，并确定了该特征潜在的免疫相关机制。重要的是，CMS与经过充分验证的免疫疗法生物标记物密切相关。CMS的预测能力将有助于患者的个性化治疗。

摘要

背景：共刺激分子在增加抗肿瘤免疫反应中起重要作用，靶向这些分子的抗体被认为是有前途的辅助癌症免疫疗法。作者的目标是对肺腺癌（LUAD）患者中B7-CD28和TNF家族的共刺激分子进行首次全面探索，并产生基于共刺激分子的信号特征（CMS）以预测存活率和对免疫疗法的反应。

方法：作者在10个不同的队列中纳入了1549例LUAD病例，包括TCGA的502个样本。验证集包括来自8个GEO数据集的970例病例，以及具有qPCR数据的77个冷冻肿瘤组织。还探讨了CMS的潜在机制和预测性免疫治疗能力。

结果：作者使用生物信息学方法构建了基于5个基于共刺激分子的基因特征（CD40LG，TNFRSF6B，TNFSF13，TNFRSF13C和TNFRSF19），该方法将患者OS分为高风险组与低风险组。多变量Cox回归分析认为CMS是独立的预后因素。不出所料，CMS在分层队列和不同的验证队列中具有显著的预后意义。此外，预后meta分析显示CMS优于先前的特征。高风险和低风险组的样本表现出明显不同的肿瘤浸润性白细胞和炎症活性。重要的是，作者发现CMS评分与多种免疫疗法生物标志物密切相关。

结论：作者对LUAD患者进行了首次最全面的共刺激分子景观分析，并建立了可用于临床预后和免疫疗法反应预测的临床可行的CMS，这将有助于进一步优化癌症的免疫疗法。

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