单细胞转录组｜scATAC-seq 数据整合

引言

本文在此展示了如何将多个源自人类外周血单核细胞的单细胞染色质数据集进行整合。其中一个数据集是通过10x Genomics的多组学技术获得的，它涵盖了每个细胞的DNA可及性和基因表达数据。另一个数据集则是通过10x Genomics的单细胞ATAC测序(scATAC-seq)技术得到的，仅包含DNA可及性信息。

将利用Seurat软件包中的工具，基于两者共有的DNA可及性检测方法，将这两个数据集合并。此外，本文^[1]还将展示如何将连续变量（如基因表达）和分类变量（如细胞标签）的信息，从一个参考数据集转移到另一个查询数据集中。

预处理

在这里，将加载预处理的 PBMC 多组数据以及 PBMC scATAC-seq 数据：