RNAseq 分析后 R 结果可视化volcano plot和heatmap（火山图和热图）

最新推荐文章于 2026-04-19 03:46:52 发布

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本文介绍如何利用R语言对RNAseq分析结果进行可视化，包括制作火山图和热图。内容基于之前的tophat2+cufflink+cuffdiff流程，并引用相关视频教程作为参考。

这个文章跟着之前的文章完整转录组RNAseq分析流程（tophat2+cufflink+cuffdiff）用了之前分析的 cuffdiff 的结果,参考视频 https://www.bilibili.com/video/BV1gW411Y7Qf
文中用到的hic的数据由于是别人的东西，就不方便放出来，可以看一下孟叔视频，加群后可以在群文件下载

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#rnaseq 可视化 孟b站 R绘图
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#content
#1. volcano plot
#2. heatmap plot
#3. cytogram plot
#4. plot with layout
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rm(list = ls())
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#part one
#1.input table cuffdiff
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#volcano plot
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cuffdiff_result = read.table(file = "../Desktop/test_data/rnaseq_test_date/diff_out1/gene_exp.diff",header = T) 
ctrl_fpkm = cuffdiff_result$value_1
treat_fpkm = cuffdiff_result