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Paquet : libssw0 (1.1-15 et autres)

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fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

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arm64 1.1-15+b3 20,2 ko84,0 ko [liste des fichiers]
armhf 1.1-15+b3 21,9 ko84,0 ko [liste des fichiers]
i386 1.1-15+b3 27,3 ko84,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 1.1-15+b3 23,7 ko84,0 ko [liste des fichiers]
riscv64 1.1-15+b3 25,7 ko60,0 ko [liste des fichiers]
s390x 1.1-15+b3 26,7 ko72,0 ko [liste des fichiers]