Pakiet: bedtools (2.31.1+dfsg-3)

Odnośniki dla bedtools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bedtools:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Zestaw narzędzi do porównywania cech genomicznych

Narzędzia BEDTools umożliwiają wykonywanie typowych zadań genomicznych, takich jak: wyszukiwanie nakładających się cech i obliczanie pokrycia. Narzędzia te w dużej mierze bazują na czterech powszechnie używanych formatach plików: BED, GFF/GTF, VCF i SAM/BAM. Za pomocą BEDTools można tworzyć zaawansowane procesy badawcze, które pozwalają na uzyskiwanie odpowiedzi na skomplikowane pytania naukowe poprzez strumieniowe łączenie kilku narzędzi BEDTools.

Narzędzie groupBy jest dostępne w pakiecie filo.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Zestaw, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing, Konwersja danych, use::filtering, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z bedtools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.38) [nie i386]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.42) [i386]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, ppc64el, s390x]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Biblioteka do kompresji w formacie XZ
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armhf]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armhf]

Pobieranie bedtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	681,7 KiB	2 148,0 KiB	[lista plików]
arm64	573,2 KiB	2 008,0 KiB	[lista plików]
armhf	559,6 KiB	1 303,0 KiB	[lista plików]
i386	740,8 KiB	2 335,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	694,6 KiB	2 584,0 KiB	[lista plików]
riscv64	652,2 KiB	1 580,0 KiB	[lista plików]
s390x	652,3 KiB	2 156,0 KiB	[lista plików]