Pakiet: bcftools (1.22-1 i inne)

Odnośniki dla bcftools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bcftools:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [samtools.github.io]

Podobne pakiety:

Wywoływanie wariantów genomowych oraz zarządzanie plikami VCF i BCF

BCFtools to zestaw narzędzi, które manipulują wywołaniami wariantowymi w formacie Variant Call Format (VCF) i jego binarnym odpowiedniku BCF. Wszystkie polecenia działają w sposób przejrzysty zarówno z plikami VCF, jak i BCF, zarówno nieskompresowanymi, jak i skompresowanymi przy użyciu BGZF.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program

Inne pakiety związane z bcftools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.42) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [ia64]

C library for high-throughput sequencing data formats

dep: libhts3t64 (>= 1.22.1) [loong64]

dep: libhts3t64 (>= 1.22.1+ds-1) [nie ia64, loong64]
dep: python3-gffutils [ia64]

Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
dep: python3-matplotlib [ia64]

System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba
dep: sse2-support [i386]

CPU feature checking - require SSE2

rec: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
rec: python3-gffutils [nie ia64]

Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
rec: python3-matplotlib [nie ia64]

System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

sug: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
sug: python3-numpy

Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)
sug: texlive-latex-recommended

TeX Live: LaTeX recommended packages

Pobieranie bcftools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.22-1	784,1 KiB	4 497,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.22-1	810,0 KiB	2 872,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.22-1	730,1 KiB	4 293,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.22-1	713,2 KiB	3 921,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.22-1	812,3 KiB	2 674,0 KiB	[lista plików]
i386	1.22-1	856,6 KiB	2 970,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.20-1	909,4 KiB	4 403,0 KiB	[lista plików]
loong64	1.22-1	779,1 KiB	4 407,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.22-1	718,9 KiB	2 505,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.22-1	827,2 KiB	4 800,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.22-1	844,8 KiB	4 797,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.22-1	797,3 KiB	2 348,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.22-1	830,0 KiB	2 927,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.22-1	863,7 KiB	4 117,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.22-1	779,2 KiB	44 486,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.22-1	804,7 KiB	2 670,0 KiB	[lista plików]