生物資訊上上有許多種Data Visualization的方式,不外乎就是在報告時能完整呈現自己的研究結果。另外在發Paper的時候也會要求高質量的圖檔,在平常訓練如何把資料漂亮、簡單、清楚的呈現出來會讓老闆很高興之外也可以讓自己的東西曝光率跟願意被聽的機率變高。所以我順手整理出了幾種在可能用到的視覺化Package,主要還是在Bioinformatics上的應用,當然如果有需要或者是很想一起研究如何畫出其他領域(新聞/財經等等)的圖也歡迎找我討論。
以下幾種是目前我覺得可能比較常使用到的ㄧ些圖,以R為主去介紹,Python或者是D3.js我會漸漸補上來。 一樣,如果有特別想要看到比較不是這麼主流的圖,也歡迎隨時找我討論。
- Heatmap
- Barplot
- Chord Plot
- Survival Curve
- [Dendrogram/Phylogenetics]
- [Network]
- Other