Python DCM转NRRD及NRRD转NII

这篇博客介绍了如何使用SimpleITK库将DICOM(DCM)格式的医学影像转换为NRRD格式,以及如何利用vtk库将NRRD格式转换为NII格式,这两个步骤对于基于radiomics的病理信息分析至关重要。

使用radiomics等库对病理信息进行分析时,可能需要用到NRRD格式的原文件与NII格式的MASK掩膜文件,所以还需要掌握DCM转NRRD以及NRRD转NII的方法

DCM转NRRD可参考这位博主的博客:dcm图片到nrrd的格式转换(二维到三维)
核心代码如下

import SimpleITK as sitk
import os

def DCMtoNRRD(file_path):
    out_path = file_path
    dcms_name = sitk.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesFileNames(file_path)
    dcms_read =
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值