PyMOL作图-输出PNG格式图片

本文介绍如何使用PyMOL软件导出PNG格式的图片,并详细解释了png命令的各个参数,包括文件名、宽度、高度、分辨率等,帮助用户定制高质量的分子结构图像。
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Python 是一种高级、解释型、通用的编程语言,以其简洁易读的语法而闻名,适用于广泛的应用,包括Web开发、数据分析、人工智能和自动化脚本

PyMOL作图-输出PNG格式图片

1. 输出PNG格式图片

可以用最简单的方式让PyMOL输出png格式的图片,在PyMOL的命令行执行如下命令:

png test.png 

2. 设置PNG的参数

png的参数如下所示:

png filename [, width[, height[, dpi[, ray[, quiet]]]]]
  • filename = string(字符串): 文件名称和文件的路径。
    - width = integer or string (整数或字符串): 宽度,单位为像素。如果给定单位后缀英尺或厘米(in, cm),则需要dpi参数。如果只给出 widthheight中的一个,则保留可视化窗口的长宽比,默认是0
  • height = integer or string(整数或字符串): 高度,默认是0
  • dpi = float: dots-per-inch 默认为 -1.0 。
  • ray = 0 或 1: 如果为1则在输出png前运行ray默认是0
  • quiet = 0 或 1: 如果为1则不输出log日志,默认是 0

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