Nacido en Luisiana, Lee Baker Jr. se aficionó al blues gracias a su abuelo, que tocaba el banjo. Sin embargo, no fue hasta los veinte años, cuando se trasladó de Luisiana a Port Arthur (Texas) a principios de la década de 1950 y se inspiró al ver a BB King, T-Bone Walker y Clarence "Gatemouth" Brown, cuando se dedicó profesionalmente a la música. Consiguió un trabajo como guitarrista en la banda de zydeco de otro músico de Luisiana, Clifton Chenier, y empezó a tocar en solitario con el nombre de Guitar Jr., teniendo un pequeño éxito con el tema "Family Rules".
Al trasladarse a Chicago, adoptó el nombre artístico de Lonnie Brooks (ya que Guitar Jr. era utilizado por otro artista) y se convirtió en una figura popular tocando en clubes de la ciudad. Siguió publicando singles y tocó la guitarra con Jimmy Reed en su álbum en directo "Jimmy Reed at Carnegie Hall". En 1969 publicó por fin su álbum de debut "Broke & Hungry" y su reputación creció cuando cuatro de sus temas se incluyeron en la influyente antología "Living Chicago Blues", publicada por Alligator Records. Siguió publicando siete álbumes con el sello, y su mezcla de estilos de blues y R&B se etiquetó como "blues vudú".
En 1986, su popularidad creció con la publicación de su álbum "Wound Up Tight", en el que también participó Johnny Winter a la guitarra. Sus hijos Ronnie Baker Brooks y Wayne Baker Brooks se unieron a su banda y también realizó giras con Buddy Guy y BB King, apareciendo más tarde en las películas "The Blues Brothers 2000" y "The Express". Murió en abril de 2017 a los 83 años.
