ubuntu虚拟机使用笔记——8、生信分析包

1、安装zlib

sudo apt install zlib1g-dev

2、安装bedtools

sudo apt-get install bedtools

3、安装samtools

先安了个这个包

sudo apt-get install libncurses5-dev

安装samtools

sudo apt-get install samtools

4、安装gcc

sudo apt install gcc

5、安装build-essential（gcc开发环境）

sudo apt-get install build-essential

6、安装ChIA-PET2

在以上安装包都安装成功的前提下，就可以无报错安装啦
进入到ChIA-PET2下打开终端

tar -zxvf ChIA-PET2-0.9.3.tar.gz

cd /home/fengyongxian/shm/tartar/ChIA-PET2/ChIA-PET2-0.9.3#进入ChIA-PET2-0.9.3目录

chmod +x bin/ChIA-PET2

make

7、安装BWA

在压缩文件地址下，打开终端

tar -zxvf bwa-0.7.17.tar.gz

进入解压文件，打开终端

make
make clean #清除垃圾文件