二、ChIA-PET2——2、安装R依赖包

最新推荐文章于 2026-04-22 18:00:00 发布

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ChIA-PET2

本文档详细介绍了如何在R环境中安装和测试ggplot2及VGAM包，包括启动R，安装data.table，以及依赖包stats4和splines的安装与测试。

一、安装ggplot

1、启动R

(base) [root@node01 ~]# R

R version 3.6.0 (2019-04-26) -- "Planting of a Tree"
Copyright (C) 2019 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit)

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[原来保存的工作空间已还原]

2、安装data.table包

install.packages('data.table', repos='https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/')

3、测试data.dable包

library(data.table)

4、安装ggplot2包

install.packages('ggplot2', repos='https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/')

5、测试ggplot2包

library(ggplot2)

6、安装VGAM包

install.packages('VGAM', repos='https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/')

7、测试VGAM包

library(VGAM)

* DONE (VGAM)
Making 'packages.html' ... 好了

下载的程序包在
	‘/tmp/RtmpOx79hb/downloaded_packages’里
更新'.Library'里的HTML程序包列表
Making 'packages.html' ... 做完了。
>  library(VGAM)
载入需要的程辑包：stats4
载入需要的程辑包：splines

安装需要的程辑包：stats4和splines

install.packages('stats4', repos='https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages ')

install.packages("caret", dependencies = c("Depends", "Suggests"))

测试包

library('ggplot2')
library('VGAM')

完成

标签

#linux